合法。用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项，对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿，因此，将保密费包含在基本工资中是符合法律规定的，但是保密费并不是工资的法定组成部分，用人单位的商业秘密确需特殊保护，可以将保密费单列作为企业的一项独立费用支出。