在《幕府将军2全面战争》中，当商船抵达贸易港之后，并不需要返回，这是因为一旦商船进入贸易点，本国港口和贸易点之间会出现一条虚线，这条虚线上有小船在移动，这表明国家已经在持续地获得贸易收入。这样的设定并非《幕府将军2》首次出现，早在前作《帝国全面战争》和《拿破仑全面战争》中就已经存在类似的机制。这种设计的初衷是为了简化玩家的操作，如果每回合都要手动操作商船，将会极大地增加操作负担，并且缺乏游戏趣味性。然而，需要注意的是，即使商船停靠在贸易点之后，也不能完全放松警惕。因为敌对国的海军可能会袭击贸易路线，甚至直接攻击本国商船，因此需要采取以下措施来确保本国海上贸易的顺利进行：首先，建立一支强大且军费在可承受范围内的海军，以保护贸易路线和贸易点的船队。其次，利用新建立的海军在贸易路线上巡航，消灭任何可能的海盗或敌国舰队。由于贸易路线通常较长，且有时海军需要被调去参战，导致无法提供足够的保护，因此在对贸易点附近的国家进行战争时要格外谨慎。除非那个国家没有军港，无法对本国商船造成威胁，否则轻易宣战可能会对本国贸易造成负面影响。