能。港澳通行证能刷卡进站。根据中国铁路总公司发布的通知，电子客票在全国实行推广。旅客通过互联网订购车票之后，到达高铁站，无需换取纸质车票，直接可持二代身份证、港澳通行证等有效身份证件通过进站口和验票闸机直接乘车。