1966-67赛季，拜仁慕尼黑在德甲联赛中名列第三，但赢得了德国杯冠军，获得了参加下赛季欧洲优胜者杯的资格。在1967年的欧洲优胜者杯决赛中，凭借弗朗茨·罗特的加时赛进球，拜仁以1比0击败了苏格兰的格拉斯哥流浪者，赢得了冠军。1968年，南斯拉夫人布兰科·泽比奇成为了拜仁的主教练，他以严格的纪律要求著称，带领球队取得了辉煌的成绩。泽比奇仅用13名球员，便带领拜仁赢得了德国足球历史上首个德甲联赛和德国杯双冠王。从1970-71赛季起，乌多·拉特克开始执教拜仁。在拉特克的首个赛季，拜仁赢得了德国杯冠军。1971-72赛季，拉特克带领拜仁获得了德甲冠军，这是球队历史上第三次赢得这项荣誉。在对阵沙尔克04的关键比赛中，拜仁5比1大胜对手，在慕尼黑奥林匹克体育场进行了德甲历史上首次直播比赛，创下多项历史记录。接下来的两年，拜仁实现了德甲三连冠的伟业。1974年欧洲冠军杯决赛的重赛中，拜仁以4比0击败马德里竞技，再次捧杯。然而，拜仁在国内联赛的表现并不理想，仅在1975年欧洲冠军杯决赛中击败利兹联，捍卫了自己在欧洲的地位。次年的欧洲冠军杯决赛，拜仁以3比1战胜法国球队圣埃蒂安，实现欧洲赛场连续三年的辉煌。同年，拜仁还赢得了丰田杯冠军。然而，在接下来的几年里，拜仁再未赢得任何重要比赛的冠军，弗朗茨·贝肯鲍尔也远赴纽约宇宙队。1979年，塞普·迈耶和乌利·赫内斯宣布退役，盖德·穆勒则加盟了劳德代尔。