这两种证书的区别是施工范围不同、办理流程不同。1、施工范围不同：土石方工程施工许可证主要针对土石方工程的施工，而施工许可证则涵盖了整个建设项目的施工。2、办理流程不同：土石方工程施工许可证的办理流程相对简单，只需要按照相关规定提交申请材料并经过审批即可。而施工许可证的办理流程则相对复杂，需要按照规定的程序和要求提交申请材料，经过多轮审批和备案程序才能获得。