昭通小吃的缺点是不卫生有安全隐患。根据微信公众平台报道可知，昭通小吃被查出还有工业致癌成分，街头小吃添加工业原料，记者取样检测，经营者承认确有吊白块用来消毒，以上就是昭通小吃的缺点。