该制度的理由有提升种子质量和增强企业竞争力。1、提升种子质量：种子是现代农业的基础，种子质量直接关系到农作物的产量和品质。通过推行农作物种子认证制度，可以以高质量种子为目标，强调过程管理的标准化质量保证体系，提升种子的质量水平。2、增强企业竞争力：种子认证是体现企业质量管理水平的重要标志，也是国际通行的种子质量管理模式。