两种糖类物质的区别是来源、结构。1、来源：大豆低聚糖是从大豆中提取得来的一种多糖物质。而90型糖是一种人工合成的糖类物质，其糖源可以是玉米或其他淀粉制品。2、结构：大豆低聚糖是由2-6个单糖分子组成的低聚体。而90型糖是一种低聚糖，其结构是由葡萄糖单元组成的聚合物。