两者的区别有:外形不同、生长环境不同、作用不同。1、外形不同:马牙瓜子细长,颜色为白色,表面有黑色的纹路;而葵花籽为瘦果,呈长形、卵形或近乎圆形,颜色有多种,可由纯白色、灰色或黑色条纹而构成。2、生长环境不同:马牙瓜子是新疆特产,种植条件特殊,喜欢在贫瘠的盐碱地生存,喜欢干旱,不能用化肥农药,亩产只有50公斤;而葵花籽原产北美洲南部和西部以及秘鲁和墨西哥北部广大地区,现在在中国主要分布在东北、华北和西北地区,在各类土壤中均能生长,从肥沃土壤到旱地、瘠薄、盐碱地均可种植,有较强的耐盐碱能力。3、作用不同:马牙瓜子具有治疗血痴、透肿毒、安神助眠、驱虫润肺的功效;而葵花籽是向日葵的种子,可供药用,具有较高的营养价值。