二者的区别在于意思和出处。1、意思不同：阻扰：防碍一些事情的发生。阻挠：暗中破坏，使某件事不顺利或不成功。2、出处不同：阻扰出自范文澜、蔡美彪等《中国通史》第三编第五章第一节：“唐宣宗任王瑞章为册立回鹘可汗使，八五七年，被黑车子室韦阻扰，半路退回。”阻挠出自清平步青《霞外攟屑·时事·刘庸夫》:“各处地方官以为不利於己，从而阻挠之。”