该县的五个土司分别是思陀土司、落恐土司、瓦渣土司、左能土司和溪处土司。这些土司在云南红河南岸的世袭封建制度中保存下来，每个土司都有自己的领地和管辖范围。思陀土司是明洪武中置的思陀甸长官司，治所在今云南红河县西南二十八里大新寨。清道光元年迁至红河县西南二十二里乐育。落恐土司是哈尼族，原属思陀，后划分出来，唐代称伴溪落恐部。在红河建县初期，落恐土司陈训民还协助政府做了大量卓有成效的剿匪和征粮工作。