这种情况下学籍号会自动转到新学校。我国实行全国中小学学籍管理制度，学籍号全国联网，一生一籍。转校过程中，原学校需办理学籍转出手续，将学生的学籍档案转移到新学校。新学校会在收到学籍档案后为学生办理学籍转入手续。所以说，转校后学籍号会自动转到新学校。