《国宝档案》栏目使用的音乐相当丰富多样，其中以日本元老级配乐组合SENS“神思者”的两部经典音乐专辑最为常见，《海上丝绸之路三部曲》和《故宫三部曲》。这两部专辑中包含多首经典曲目，比如《迦罗》、《茶之圆舞曲》和《海神》等。其中，《迦罗》的曲目包括myooncho、hicho和anton，《茶之圆舞曲》则包括HappyArabia、JambiaDance和Compass，《海神》的曲目则是THEGODOFTHESEA、SIGIRIYALADY和APHRODITE。除此之外，《故宫三部曲》中的《故宫》、《故宫续曲》和《再见！故宫》也常被使用。《故宫》包含PalaceMemories、Treasures和TheDragon，《故宫续曲》则有PipesofWar，《再见！故宫》则使用了EdgeoftheStorm和SeedofHope。除此之外，栏目中还使用了《悲情城市》中的曲目ACITYOFSADNESS。值得注意的是，《国宝档案》栏目还使用了一些游戏音乐，如《轩辕剑三外传－天之痕》中的“如忆玉曲”。虽然一些人认为栏目在“盗用”经典曲目，但我认为音乐的价值在于其广泛传播和受众认同。许多纪录片和电视剧的配乐都采用来自不同国家的优秀作品，这是因为这些作品能够更恰当地配合情景，产生共鸣。我个人认为，只要音乐运用得当，这种做法并没有什么不好。当然，这只是我个人的观点，欢迎大家提出不同的意见进行讨论。