股权变更主要涉及以下几种税和费用：

1、个人所得税

当个人股东转让股权时，需要缴纳个人所得税。应纳税额的计算公式为：应纳税所得额=股权转让收入-股权原值-合理费用，税率为20%。

2、印花税

印花税是按产权转移书据征收的，税率为合同金额的万分之五。股权转让协议双方都需要缴纳印花税。

3、企业所得税（针对企业股东）

如果股东是企业，转让股权的收入需要并入企业的应纳税所得额，依法缴纳企业所得税。

4、增值税

对于非上市公司的股权转让，不需要缴纳增值税。

股权变更的具体流程如下：

1、决策与协商

在股权变更前，涉及的股东需要进行协商和决策，确定变更的原因、方式和具体内容。这一过程应遵守公司章程、相关法律法规和合同约定，并经过内部决策程序。

2、签订协议

股权转让双方需签订《股权转让协议》，明确股权转让的价格、交接、债权债务、股权转让款的支付等事宜。

3、召开股东会

公司受让股权后，需召开股东会，形成股东会决议。

4、准备材料

准备齐全相关资料，包括旧的公司章程、新的公司章程、营业执照正副本、公章、各股东身份证等。

5、领取《公司变更登记申请表》

到工商局办证大厅窗口领取《公司变更登记申请表》。

6、变更营业执照

填写公司变更表格，加盖公章，整理公司章程修正案、股东会决议、股权转让协议、公司营业执照正副本原件到工商局办证大厅办理。

7、变更组织机构代码证

填写企业代码证变更表格，加盖公章。

8、办理税务变更手续

根据相关规定完成税务变更手续。

9、更新股东名册和修改公司章程

最后更新股东名册，修改公司章程。

股权变更的准备材料如下：

1、基础资料

（1）营业执照正副本原件及复印件，确保公司营业执照的有效性。

（2）法人及新旧股东身份证复印件，所有涉及变更的股东和法人的身份证明。

（3）公章，用于各类文件的盖章确认。

2、股权转让相关文件

（1）股权转让协议，明确双方权利和义务，包括转让的份额、价格、支付方式等细节。

（2）股东会决议或决定，需由公司股东会审议通过，并加盖公章。

（3）公司章程修正案，如股权变更涉及公司章程的修改，需提交修改后的公司章程或修正案。

3、税务相关文件

（1）近一个季度的财务报表、股权转让计税依据等。

（2）资产评估报告，若转让的资产（如房产、知识产权等）占比超过20%，需提供具有法定资质的中介机构出具的资产评估报告。

4、特殊关系证明

若股权转给直系亲属，需提供结婚证、户籍证明等相关资料。

《中华人民共和国市场主体登记管理条例》

第二十四条

市场主体变更登记事项，应当自作出变更决议、决定或者法定变更事项发生之日起30日内向登记机关申请变更登记。

市场主体变更登记事项属于依法须经批准的，申请人应当在批准文件有效期内向登记机关申请变更登记。

《中华人民共和国个人所得税法》

第十五条

公安、人民银行、金融监督管理等相关部门应当协助税务机关确认纳税人的身份、金融账户信息。教育、卫生、医疗保障、民政、人力资源社会保障、住房城乡建设、公安、人民银行、金融监督管理等相关部门应当向税务机关提供纳税人子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等专项附加扣除信息。

个人转让不动产的，税务机关应当根据不动产登记等相关信息核验应缴的个人所得税，登记机构办理转移登记时，应当查验与该不动产转让相关的个人所得税的完税凭证。个人转让股权办理变更登记的，市场主体登记机关应当查验与该股权交易相关的个人所得税的完税凭证。

有关部门依法将纳税人、扣缴义务人遵守本法的情况纳入信用信息系统，并实施联合激励或者惩戒。