桑塔纳2000发动机大修后车身抖动可能是由多种原因导致的。常见的可能原因包括发动机安装不当、配重不平衡或者某些零部件未能正确安装或调试。为了解决这一问题，建议首先检查发动机的固定情况，确保所有螺栓都已紧固且安装位置正确。接着，可以检查发动机的平衡情况，确认是否存在配重问题。此外，还应详细检查所有相关零部件，如点火系统、燃油系统和排放系统等，确保它们都已按照厂家规定正确安装并调试。如果发现任何问题，应及时请专业人士进行修复或调整，以确保车辆平稳运行。如果以上检查都未能解决问题，建议将车辆送至专业的汽车维修店进行全面检查，以便准确诊断并解决车身抖动的问题。