1、产地不同：巧克力原产于中南美洲，主要原料可可豆产于赤道南北纬18度以内的狭长地带。可可则原产于美洲中部及南部，并在中国海南和云南南部有栽培。2、成分不同：巧克力含有可可碱、苯乙胺等成分。可可的种子则含有多种可药用的化学成分，从可可豆中可以提取出包裹在外层的白色硬壳（脂肪部分）和可可粉（脱脂部分）。3、制作原料不同：巧克力是以可可浆和可可脂为主要原料制成的一种甜食。可可的种子则是制造可可粉和“巧克力糖”的主要原料，同时也是世界上三大饮料之一。4、形态不同：巧克力在制造过程中所加进的成分不同，使其具有多变的面貌，基本上有固体或半固体的形态。而可可则是常绿乔木，树皮厚，嫩枝褐色，被短柔毛。5、食用价值不同：巧克力可维持和促进心血管健康，其中的黄烷醇和原花青素对心血管保护、血压调节、增加一氧化氮产生、氧化防御以及免疫系统等方面都有积极作用。