在电视剧《少年包青天第二部》中，公孙策所患的具体病症并未明确说明。剧情中提到，他感染了一种怪疾，这导致了双目失明。这种描述更多地是为了推动剧情发展而设定的情节，而非基于现实生活中的医学疾病。因此，我们无法从剧情中得到关于公孙策所患疾病的确切信息。在电视剧的情节中，这种失明成为了公孙策人物故事的一部分，并在后续的剧情中得到了解决。