雇佣关系，工作安排。1、雇佣关系：自由船员是通过劳务派遣或中介机构与航运公司签订合同的船员，而自有船员是航运公司直接雇佣的船员。2、工作安排：自由船员是根据合同约定，在特定的航线上工作，会根据需要转到其他航线上。而自有船员则是长期在航运公司工作，按照公司的调度和安排进行工作。