是。自然堂是知名化妆品品牌，对于旗舰店的要求非常严格，确保销售的产品是正品，同时，抖音平台也会对旗舰店进行监管，发现假货或质量问题，会对商家进行处罚，因此抖音自然堂美妆旗舰店是正品的。