贵州医科大学。1、研究机构不同：贵州医科大学有国家工程研究中心1个，国家苗药工程技术研究中心，国家地方联合工程中心2个，细胞工程生物医药技术国家地方联合工程中心、化学药仿创技术应用国家地方联合工程研究中心。遵义医科大学有教育部重点实验室1个、教育部国际合作联合实验室1个。2、教学建设不同：贵州医科大学有国家级特色专业4个，临床医学、药学、预防医学、医学检验，国家级专业综合改革试点2个，药学、临床医学，国家级卓越人才教育培养计划项目1个，遵义医科大学也有国家级特色专业4个，口腔医学、麻醉学、临床医学、护理学，没有贵州医科大学多。