尤贵反马永贞的原因主要有两点。首先，尤贵为了获取刀爷的信任和金钱，选择恩将仇报，残忍杀害马大娘，与马永贞反目成仇。其次，尤贵认为马永贞发动的反清复明运动只会给清朝带来更多的混乱，而不是解决问题，因此他发动反马永贞运动，反对马永贞的行动。