植物种类、根系分泌物、土壤肥力。1、根际微生物的数量以及结构的变化导致了根际微生物群落的变化，植物的种类不同，其根际土壤中微生物的功能、结构和种类也不同。2、植物的根系在新陈代谢时从环境中摄取养分与水分的同时，也向周围土壤中不断分泌着有机化合物，根系分泌物给根际微生物提供了营养和物质能量，从而使得根际效应得以产生。3、土壤肥力对根际微生物的发育有着很大影响，根际微生物的生长依赖于土壤的肥力水平，微生物和土壤肥力之间具有协同发展和相互促进的关系。