二者区别在于来源不同、时代背景迥异、文化意义。1、来源不同：南京十二钗源自清代小说《红楼梦》，是书中的核心女性角色，包括林黛玉、薛宝钗等十二位人物；而金陵十三钗则来自严歌苓的同名小说及张艺谋执导的电影，讲述的是抗日战争时期南京的一段虚构历史故事。2、时代背景迥异：十二钗的故事发生在清朝中叶封建社会背景下，围绕贾宝玉及其身边女性的生活展开；而十三钗的故事设定在现代史上的抗日战争时期，展现了特殊历史环境下女性的勇气与牺牲。3、文化意义：十二钗反映了封建社会下女性的命运与情感世界，具有深刻的社会批判和人文关怀内涵；十三钗则更多地体现战争对普通人生活的影响，以及在生死关头人性的光辉。