党员身份认定困难，影响党组织的管理和运作。1、党员身份认定困难：党员信息被删除，那么对于该党员的党员身份认定将会变得非常困难。因为要确定其党员身份需要许多信息，入党时间、组织关系等。这导致一些党员的身份无法得到确认，从而失去党员身份的合法性和有效性。2、影响党组织的管理和运作：党统系统中的党员信息被删除，那么党组织的管理和运作也会受到影响。党组织无法对党员进行有效的管理和监督，也无法及时发现和处理违规行为。这将对党的纪律建设和组织建设造成一定的影响。