职责不同、级别不同。1、职责不同：学科带头人主要负责学科建设和发展，制定学科发展规划，组织开展学术研究，培养学科人才等，而主任则负责整个部门或组织的日常管理工作，包括人员管理、财务管理、物资管理等。2、级别不同：学科带头人是高级专业技术职称，在学术领域具有一定的知名度和影响力，而主任则是中层管理职务，负责组织和协调各项工作的顺利开展。