药用部位不同、功效不同。1、药用部位不同：天花粉的药用部位为根茎，而瓜蒌根的药用部位为根及根茎。2、功效不同：天花粉具有清热解毒、消肿止痛、抗菌消炎等功效，用于治疗感冒发热、咽喉肿痛、疮疖肿痛等症状，瓜蒌根则具有润肺止咳、宽胸散结、清热解毒等功效，用于治疗咳嗽、胸闷、胸痛等症状。