乙脑自费和免费的差别如下：1、疫苗种类不同：自费乙脑疫苗属于灭活疫苗，免费乙脑疫苗属于减毒活疫苗。2、接种时间不同：自费疫苗需要接种四针，在八月龄时需要接种两针，在两岁、六岁时个接种一针；免费疫苗需要接种两针，分别在八月龄和两岁时。3、如果孩子对硫酸庆大霉素过敏，或者存在其他接种疫苗的禁忌症，可以考虑接种自费的乙脑疫苗，如果孩子没有免费乙脑疫苗的禁忌症，推荐接种免费的乙脑疫苗。