职责不同，设立目的不同，名称不同。1、职责不同：卫生厅负责管理和组织本地区的卫生工作，卫健委负责卫生健康管理、卫生健康政策制定、卫生健康监督等任务。2、设立目的不同：卫生厅的设立是为了管理和组织本地区的卫生工作，卫健委的设立是为了适应卫生健康体制改革和卫生健康事业发展的需要，推动全面深化医药卫生体制改革。3、名称不同：卫生厅是过去的机构名称，卫健委是现行的机构名称。