以自然年为单位。根据律临网查询显示：灵活就业养老保险目前第一次交费的时候是以自然年为单位，可以把当年度的保费一次交清，比如你十月份登记参保，那么可以交十个月的保费，如果你是一月份参保，那就只能交一个月保费。所以，灵活就业只能交一个月的原因是以自然年为单位。