氯氟醚菊酯毒性更大。根据百度百科查询，，菊酯氯氟醚菊酯相对于右旋反式烯丙菊脂在杀灭虫害或杀菌方面具有更高的效果，这意味着它在生物体内的作用更强。菊酯类农药杀灭虫害或杀菌是通过抑制神经途径来实现的，菊酯氯氟醚菊酯相对于右旋反式烯丙菊脂具有更强的神经毒理效应，对目标生物体的神经系统产生更强的抑制作用，导致其更强的毒性效应。