公司合理避税。工资分两笔打入的原因可能是由于公司合理避税，减少交纳税款。工资应当缴纳个人所得税。综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。