如果总公司任命合资公司的办公室主任，但是总经理不同意，可以采取以下措施：1.了解总经理的反对原因：首先需要了解总经理反对的原因，可能是对候选人的能力、经验、性格等方面存在疑虑，或者是因为总经理有自己的想法和计划。2.沟通和协商：在了解总经理的反对原因后，可以与总经理进行沟通和协商，解释候选人的优势和能力，同时听取总经理的意见和想法，寻求达成共识的方式。3.提交任命建议：如果总经理仍然不同意，可以向公司高层提交任命建议，并陈述自己的理由和依据，让公司领导层进行决策。4.遵循公司规定：在任何情况下，需要遵循公司的规定和程序，避免违反公司制度和管理流程。