遗迹上层的箱子中。根据百度游戏-乐玩-乐玩相关资料显示：晶核备用魔导动力核心位于遗迹上层的箱子中。玩家需要进入矿洞，打开石门，再开箱子，然后与托马斯对话。之后，玩家需要进入遗迹上层，在往下层的电梯口，打开房间里面的箱子，便能获取晶核备用魔导动力核心。晶核备用魔导动力核心是《晶核》游戏中的稀有物品，获得后，可以将其与其他材料合成高品阶武器。