苯基、脂肪烃基和芳香烃基。醌类化合物中的取代基可以影响醌类化合物的稳定性、溶解度和生物学活性等性质，如苯基取代可以使醌类化合物更稳定，而脂肪烃基取代则可以增加溶解度，此外，有些醌类化合物还含有其他官能团，如羟基、甲氧基和羧基等，这些官能团也可以影响其性质。