西省职教本科毕业生的个人档案和本科学校有以下不同：1.档案管理机构不同：职教本科毕业生的档案管理机构可能是江西省教育厅或江西省人力资源和社会保障厅，而本科学校的档案管理机构则是学校自身的档案室。2.档案内容不同：职教本科毕业生的档案可能包含职业技能培训、职业资格证书等信息，而本科学校的档案则主要包含学业成绩、学位证书等信息。3.档案用途不同：职教本科毕业生的档案可能主要用于求职、晋升等方面，而本科学校的档案则主要用于学业评价、学位认证等方面。