JS1型和JS2型防水涂料主要有以下区别：1.适用部位不同。JS1型防水涂料主要用于变形较大的部位，如屋面、地下室等。而JS2型防水涂料主要用于变形较小的部位，如外墙、厕浴间等。2.组分不同。JS1型防水涂料是单组分环保型防水涂料，而JS2型防水涂料是双组分环保型防水涂料。3.性能不同。JS1型防水涂料以丙烯酸聚合物乳液为主要原料，形成的涂膜具有高延伸性和良好的耐候性，能够适应较小的变形和较大的温差变化。而JS2型防水涂料以高铝含量的铁水泥为主，形成的涂膜具有强度高、耐水性好等特点，适用于长期浸水环境。