矿山二级建造师在煤矿中不能担任副科长。矿山工程二级建造师是一种执业资格证书，凭借着矿山工程二级建造师证书，可以担任项目经理，可以承担中、小型工程施工项目负责人。矿山工程就是以矿产资源为基础，在矿山进行资源开采作业的工程技术学。包括地面和地下工程，地面工程主要包括矿用机械设备及设施，如选厂，井塔，卷扬机，压风机通风机等，地下工程包括井巷工程，硐室工程及部分安装工程。