不可以。沼气存储罐的底部有洞会导致沼气泄漏，无法达到燃烧所需的压力和浓度，燃烧无法持续，因此不能烧水。此外，沼气中含有多种有害气体，如甲烷、硫化氢等，泄漏后可能对环境和人体健康造成危害，因此要及时修复漏点。如果暂时无法修复，应立即停止使用并采取相应的安全措施。