有效。经公安系统备案的发票专用章是有效的，经公安局备案的印章，是合法并且受法律保护的印章。备案是指公司所用的发票专用章是经公安局审核并批准，并持有许可证的印章。主要是为了防止以后在经营中有人仿造你的印章，而给你带来经济损失。一般需要备案的印章有公章、财务章、法人章。