专业组成不同，建设部门不同。1、专业组成不同：业主是由相应资质的企事业单位组成的相关专业人员，而业主建立的项目管理机构是自营工程的施工队，国营建筑公司，安装公司，工程队，市政公司及集体施工企业等组织机构。2、建设部门不同：业主也称为建设单位或项目业主，是建设工程项目的投资主体或投资者，而业主建设的项目管理机构是相对于自己所在的，或者所要了解的单位而言，单位部门具有较大权限。