国税局级别高。卫健局是地方政府管理的部门，属于正科级级别的单位，而国税局属于中华人民共和国国务院主管税收工作的直属机构，属于正部级单位，由于行政级别的排名是正国级—副国级—正部级—副部级—正厅级—副厅级—正处级—副处级—正科级，因而国税局的级别高。