建设水利工程、环境整治工程和社会经济发展工程三大部分。1、水利工程的主要内容包括开挖渠段、修建排汛道、建造排汛渠梗缝和防汛堤等。2、环境整治工程包括改善水质、减少生态破坏、改善水土保持等。3、社会经济发展工程则主要包括建立有效的管理机制、搭建绿色产业链，以及扶持当地经济发展等。草塘十二塘二期工程还需要实施野生动物保护措施，以防止湿地及生态系统的破坏。