按房产所在地清算。根据《中华人民共和国土地增值税暂行条例》（国务院令第138号）第十条规定，纳税人应当自转让房地产合同签订之日起七日内向房地产所在地主管税务机关办理纳税申报，并在税务机关核定的期限内缴纳土地增值税。除了土地增值税，房地产相关的税费还包括契税、房产税、城镇土地使用税等。