大众机电单元原厂和在制造厂的区别是厂家不同、质量不同。1、厂家不同：原厂指的是机电单元的制造厂家，它是机电单元的正式制造厂家。在制造厂指的是大众机电单元在汽车制造厂内进行组装的厂家。2、质量不同：原厂生产的机电单元的品质和质量更有保障，在进行生产过程中，原厂可以进行更为严格的质量控制和检测，确保生产出来的机电单元符合质量标准和规范，从而保证机电单元的性能和可靠性。在制造厂的机电单元虽然也需要进行质量检测和控制，但是由于并不是原厂生产的机电单元，因此其品质和可靠性相对原厂生产的机电单元略有欠缺。