海关电子口岸卡的用途是进出口货物申报和办理监管业务。1、进出口货物申报：持有海关电子口岸卡的企业或个人可通过海关电子口岸平台进行进出口货物申报，包括报关、报检、报验等相关手续。2、办理监管业务：海关电子口岸卡也可以用于办理海关的监管业务，如保税区备案、加工贸易备案等。