区别在于付款的时间和方式不同，具体如下：1、付款的时间不同：月度付款是指根据合同规定，分期向承包商支付工程款项，每个月支付一定的金额。里程碑付款是指根据合同规定，在达到一定的里程碑或阶段性目标后，向承包商支付工程款项。2、方式不同：月度付款方式一般适用于长期工程或需要长时间完成的项目，可以减轻承包商的资金压力，也有利于监督工程的进展。里程碑付款方式适用于工程周期较短、进度紧迫的项目，可以促进承包商尽快完成工作，同时也可以控制工程成本。