电话办理船员证不违法。在中国，目前没有明确的法律禁止通过电话办理船员证。因此，有人声称可以通过电话方式办理船员证，从法律角度上讲，并不属于违法行为。您对通过电话办理船员证存在疑虑或发现了违规操作可以联系当地的海事管理机构、航运主管部门或海关等相关部门，咨询他们关于电话办理船员证的规定和程序。