机关单位应当设立专门负责保密工作的部门：1.设置保密工作机构。2.机关单位应当明确或者指定保密工作机构，专门负责保密工作。3.在一般情况下，根据不同级别和涉密人员数量的多少，需要设立专门的保密工作机构。