衣原体是一种微生物，其特点在于细胞较小，直径为0.2～0.3μm，能通过细菌滤器，在光学显微镜下勉强可见。它们细胞呈球形或椭圆形，细胞构造、化学成分与细菌相似，有革兰氏阴性细菌的特征细胞壁（但缺肽聚糖），细胞内同时含有DNA和RNA两种核酸，有核糖体。衣原体以二等分裂方式进行繁殖，有不完整的酶系，尤其缺乏产能代谢的酶系，须严格的活细胞内寄生。在实验室中，衣原体只能用鸡胚卵黄囊膜、小白鼠腹腔或HeLa细胞组织培养物等活体进行培养。衣原体抵抗力较低，对热敏感，在56～60℃下仅能存活5～10min。在冰冻条件下可存活数年。除鹦鹉热衣原体对磺胺具有抗性外，对一般消毒剂和抑制细菌的抗生素和药物（如四环素、氯霉素、红霉素、青霉素及磺胺等）敏感。DNA相对分子量很小，5×108，仅为大肠杆菌的1/4。衣原体具有感染力的个体称为原体，是一种不能运动的球状细胞，直径小于0.4μm，有坚韧的细菌型细胞壁，在宿主细胞内，原体逐渐伸长，形成无感染力的个体，称作始体。这是一种薄壁的球状细胞，形体较大，直径达1～1.5μm，它通过二等分裂的方式在宿主的细胞质内形成一个微菌落，随后大量的子细胞又分化成较小而厚壁的感染性原体，一旦宿主细胞破裂，原体又可重新感染新的细胞。目前已发现的衣原体有：引起人体沙眼的沙眼衣原体、引起鹦鹉热等人兽共患病的鹦鹉热衣原体、引起肺炎的肺炎衣原体。支原体（Mycoplasma）是另一种微生物，是最简单的原核细胞，大小介于细菌与病毒之间,直径为0.1～0.3um,约为细菌的十分之一,能够通过滤菌器。支原体形态多变,有圆形、丝状或梨形，光镜下难以看清其结构。支原体具有细胞膜，但没有细胞壁。它有一环状双螺旋DNA，没有类似细菌的核区(拟核),能指导合成700多种蛋白质。支原体细胞中惟一可见的细胞器是核糖体，每个细胞中约有800～1500个。支原体可以在培养基上培养，也能在寄主细胞中繁殖。常见的有肺炎支原体、人型支原体、解脲支原体、沙眼衣原体。立克次氏体是专性细胞内寄生、行二分裂繁殖的原核微生物类群。英国医生立克次氏（H.T.Ricketts）研究斑疹伤寒时发现，并于1919年命名。大小介于细菌与病毒之间，除Q热立克次氏体外，均不能通过细菌滤器。细胞球状、杆状或多形态。球状体直径0.2～0.5微米，杆状体大小0.3～0.6×0.8～20微米，有些种在细胞分裂前可长达4微米。形态特征对种的鉴定有重要意义。革兰氏染色阴性。在光学显微镜下可见，存在于宿主的胞质或细胞核中。细胞结构与细菌相似，细胞壁中含有胞壁酸，二氨基庚二酸等与细菌细胞壁相同的成分；对溶菌酶敏感，含DNA和RNA两种核酸，其比例为1∶35，具有发展自身代谢的能力，但由于细胞外膜的渗透特性，它们不能控制代谢物的吸收和排出，因此只能在宿主细胞内生长繁殖。常见的立克次氏体有伯纳特立克次体.莫氏立克次体,东方立克次体,普氏立克次体,恙虫病立克次体。支原体（Mycoplasma）、立克次氏体(Rickettsia)和衣原体(Chlamydia)是三类革兰氏阴性细菌，其大小和特性均介于通常的细菌与病毒之间。常见的革兰氏阴性细菌有大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏杆菌、多杀巴斯德氏杆菌、雏白痢沙门氏菌、产气杆菌。