草摩由希爱过本田透。

详细解释如下：

一、动漫角色情感表达

在动漫世界中，情感表达是角色之间互动的重要组成部分。草摩由希和本田透作为某些动漫中的主角，他们之间的情感纠葛是故事发展的核心线索之一。

二、由希对透的情感变化

草摩由希与本田透的交往过程中，由希逐渐对透产生了深厚的感情。这种情感并非一蹴而就，而是在共同的经历、相互的支持与理解中逐渐积累的。由希的温柔、关心以及他为本田透所做的种种，都体现了他对透深厚的感情。

三、情感发展的自然过程

在动漫故事中，角色的情感发展往往遵循一个自然的过程，从陌生到熟悉，从误解到理解，再到最后的情感交融。草摩由希和本田透的关系也遵循了这一规律。他们共同经历了许多风风雨雨，最终由希对透产生了深深的爱意。

四、故事剧情的诠释

从动漫的剧情和角色的互动来看，草摩由希的爱意是明显而深刻的。他不仅在日常生活中关心本田透，而且在关键时刻总是挺身而出，保护透并为他付出一切。这种深沉的情感，无疑是由希对透真挚的爱情的体现。

综上所述，从动漫中的角色互动、情感发展的自然过程以及故事剧情的诠释来看，草摩由希确实爱过本田透。